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全新可重分析!代谢组质谱专用
2026/10/11 1:47:36 网站建设 项目流程

摘要

代谢组学研究覆盖极为广阔的化学空间,产生大量实验数据,在化学、生物学及相关领域具备极高复用潜力。本文开发全新代谢组学质谱数据库MB‑POST,设计理念区别于现有平台,旨在充分释放上述数据价值。MB‑POST实现面向重分析的元数据框架,采集数据复用必需的关键信息;同时提供流程简化的数据提交系统,支持标准化代谢组学元数据与实验数据快速上传。该平台自2024年12月公开试点上线后,获得领域广泛使用,上线1年半时间内已存入170余个实验项目。因此,MB‑POST为代谢组学质谱数据的大规模复用奠定实践基础,是推动开放、数据驱动科学研究的1项实质性进展。

https://repository.massbank.jp

fmatsuda@ist.osaka‑u.ac.jp

okd@med.niigata‑u.ac.jp

#MBPOST #代谢组学 #质谱 #数据重分析 #元数据 #公共数据库 #FAIR原则 #MassBank

MB‑POST整体概念示意

代谢组学研究者提交附带高质量元数据的质谱数据集;MB‑POST定义的元数据满足重分析需求,同时保证输出数据可兼容MassBank;存入的数据支持后续重分析与复用,面向广大化学领域研究者开放,依托积累数据集开展重分析,进一步推动数据驱动的化学科学发展。

方法

元数据管理

图1 MB‑POST中「样本」预设模板输入界面截图

增量检索功能允许用户在预定义选项之外选择受控术语;

右侧面板展示关键元数据字段的上下文说明与填写示例。

图2 在项目内为文件分配预设配置文件的界面截图

用户通过顶部标签页选择待上传文件类型(原始数据、峰表、鉴定结果、生物学重复、其他)。针对原始数据文件,先从下方列表选择需要的预设组合,再将目标文件拖拽至页面虚线框区域,即可一次性为多个文件分配同一套预设配置。页面底部表格展示本项目全部文件列表,同时显示每个文件已经绑定的预设名称。

图3 MB‑POST元数据分配概念示意

用户创建单个「项目」用于存放提交数据集;1个项目可包含多类文件:原始数据、峰表数据、鉴定结果、重复样本数据。每个原始数据文件均分配来自4大元数据分类(样本、前处理、分析条件、软件设置)的预设组合。

结果与讨论

图4 从预设与项目注册到数据公开发布的完整工作流

撰写/修订稿件阶段(或为已发表论文注册数据):创建预设、填写元数据;创建项目;选择、修改项目内待录入文件,将预设关联至原始数据;上传文件,完成提交。提交后项目在发布日期之前保持私有状态。 同行评审阶段:生成仅审稿人可访问的预览链接与PIN验证码,将链接通知审稿人,继续进行稿件评审;根据审稿意见修订预设、元数据与项目内容。 稿件接收后:设置项目发布日期,项目内容确认定稿,数据集对外公开发布。 平台支持embargo(延迟公开)提交;项目尚未公开时,用户可直接修订提交内容,无需系统管理员介入。

详细总结

思维导图

代谢组现有数据库痛点

3大顶层设计原则

核心创新

Preset预置元数据模板

关键工程技术特性

上线后统计

至2026‑05

与其他主流代谢组库简单对比

参考

Anal Chem. 2026 Aug 11;98(31):22609-22617. doi: 10.1021/acs.analchem.6c00697.

Reviving Data Potential─The Reanalysis-Driven Metabolomics Data Repository MB-POST

注:AI辅助创作,如有不当欢迎指出。内容仅供参考,不构成任何建议。

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