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cuttag测序
2026/10/24 11:34:43 网站建设 项目流程

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各类仪器设备投资超1个亿,高标准恒温繁育基地200+亩

案例展示

图 CUT&Tag技术鉴定全基因组范围内GhLYI结合位点(Zhang et al., 2023)。

参考文献

1.Kaya-Okur H S, Wu S J, Codomo C A, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells.Nat. Commun. 10, 1930[J]. 2019.

2.Zhang Y, Zang Y, Chen J, et al. A truncated ETHYLENE INSENSITIVE3-like protein, GhLYI, regulates senescence in cotton[J].Plant Physiology,2023, 193(2): 1177-1196.

背景说明

CUT&Tag技术的核心是在Tn5上融合了protein A/G抗体结合功能域的转座体pAG-Tn5。在进行CUT&Tag实验时,首先进行靶蛋白特异性抗体(一抗)孵育,使抗体进入细胞与靶蛋白结合。为了放大信号,同理接着进行二抗孵育。最后孵育pAG-Tn5转座体,使得转座体进入细胞并与抗体结合,这样就把转座体间接的固定在靶蛋白上,随后加入Mg2+,激活Tn5酶的切割活性,切断靶蛋白结合的DNA区域。由于Tn5连有测序接头,在打断的同时直接在片段化的DNA上加接头,接着提取DNA,进行PCR扩增构建文库。

该技术克服了ChIP-seq需要的样本细胞量大,需要经过甲醛交联、超声物理性打断等步骤,由于未对细胞核和染色质进行物理性的破坏,整个操作过程相当“温和”,因此CUT&Tag的背景噪音数据非常少,对起始细胞量的要求大幅减少,且数据可重复性好。

图 CUT&Tag技术原理图(Kaya-Okur et al., 2019)。

服务流程

订单/实验材料确认——样品前处理——抗体孵育——Protein A/G-Transposome孵育——转座子激活——DNA片段化——DNA提取——文库扩增与纯化——高通量测序——数据分析——结果交付

服务内容及说明

技术应用

1、用于表观遗传学领域的蛋白质与DNA互作研究;

2、研究转录因子在全基因组上的结合或分布位点;

3、研究组蛋白修饰在全基因组上的分布位点;

4、寻找转录因子下游调控的靶基因。

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