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亮点

• 依托最新技术进展，基于质谱的单细胞蛋白质组学已可实现细胞异质性图谱解析，解答核心生物学问题。

• 各类实验策略（包括新型工作流程与数据采集方法）持续创新并快速迭代，显著提升分析能力。

• 单细胞蛋白质组学已成为多组学整合的关键技术，为解析细胞功能提供核心维度的认知。

• 随着蛋白质组覆盖度与分析通量的持续优化，基于质谱的单细胞蛋白质组学有望在科研领域得到更广泛应用。

摘要

单细胞蛋白质组学（SCP）已成为在蛋白质水平解析细胞异质性的变革性技术。质谱工作流程在样本制备、肽段分离、数据采集与解析环节的持续革新，实现了单细胞分辨率下前所未有的蛋白质组覆盖深度与分析通量。除技术创新外，SCP正用于解答肿瘤学、发育生物学、神经科学领域的复杂生物学问题，揭示动态细胞状态与调控机制。与其他单细胞组学的整合，填补了基因型-表型关联的研究缺口，揭示多层级调控规律。本文综述SCP技术的最新进展，重点介绍新兴应用与整合策略，标志着该领域从技术研发迈向广谱生物学解析的新阶段。

jwalley@iastate.edu (J.W. Walley)

#单细胞蛋白质组学 #质谱 #单细胞分离 #样本制备 #数据采集 #多组学整合 #细胞异质性

基于质谱的单细胞蛋白质组学：从方法学走向解答生物学问题

图1  基于质谱的单细胞蛋白质组学（SCP）通用流程

(1) 采用荧光激活细胞分选（FACS）或自动化分配系统（如cellenONE）从bulk样本中分